Kluczową różnicą między przetrwalnikami bakteryjnymi a zarodnikami grzybów jest organizacja komórkowa obu typów zarodników. Przetrwalniki bakteryjne to uśpione struktury obecne w bakteriach prokariotycznych. Zarodniki grzybów to struktury rozrodcze obecne w grzybach eukariotycznych.
Bakteryjne przetrwalniki są obecne w komórkach bakteryjnych i są uśpionymi strukturami, które mogą przetrwać w trudnych warunkach środowiskowych. W konsekwencji te przetrwalniki kiełkują, gdy zostaną spełnione odpowiednie warunki środowiskowe. W przeciwieństwie do tego zarodniki grzybów są egzosporami, które uwalniają się na zewnątrz w celu zarodnikowania.