Kluczowa różnica między allozymami i izozymami polega na tym, że allozymy są kodowane przez różne allele w tym samym locus. Ale z drugiej strony izoenzymy są kodowane przez geny w różnych loci.
Enzymy to biokatalizatory, które przyspieszają reakcje biochemiczne. W rzeczywistości są to cząsteczki białek kodowane przez geny. Istnieją różne rodzaje enzymów. Niektóre enzymy są kodowane przez różne allele tego samego genu obecne w tym samym locus. Są znane jako allozymy. W przeciwieństwie do tego, niektóre enzymy są kodowane przez różne geny zlokalizowane w różnych loci. Te enzymy są znane jako izoenzymy. Izozymy i allozymy mogą służyć do określenia związku między dwoma organizmami.