Kluczową różnicą między prokariotycznym i eukariotycznym DNA jest to, że prokariotyczny DNA swobodnie unosi się w cytoplazmie, podczas gdy eukariotyczny DNA znajduje się wewnątrz jądra.
Istnieją dwie główne kategorie żywych organizmów, takie jak prokarionty i eukarionty. Różnią się od siebie organizacją komórkową. W związku z tym prokarionty mają prostą organizację komórkową. Brakuje im jądra i organelli związanych z błoną. Z drugiej strony eukarionty mają złożoną organizację komórkową. Mają prawdziwe jądro, które zawiera DNA, a także organelle komórkowe związane z błoną. Wszystkie prokarionty są jednokomórkowe, podczas gdy eukarionty mogą być organizmami jednokomórkowymi lub wielokomórkowymi. Prokariota i eukarionty zawierają głównie genomy DNA. Ich DNA jest upakowane w chromosomach. Ponieważ prokarionty nie mają jądra, ich DNA swobodnie pływa w cytoplazmie. Jednak u eukariontów chromosomy znajdują się wewnątrz jądra. W związku z tym błona jądrowa otacza całe eukariotyczne DNA.
