Kluczowa różnica między izolacją genomowego DNA i plazmidowego DNA polega na tym, że izolacja genomowego DNA ma na celu ekstrakcję genomowego DNA, podczas gdy izolacja plazmidowego DNA ma na celu ekstrakcję plazmidowego DNA bakterii.
Izolacja DNA to proces chemiczny stosowany do izolowania DNA z różnych gatunków lub z różnych próbek. Izolacja DNA jest ważna w dalszych technikach biologii molekularnej, takich jak elektroforeza żelowa, reakcja łańcuchowa polimerazy i techniki sekwencjonowania DNA. Dlatego izolacja DNA jest podstawowym procesem chemicznym w badaniach biologii molekularnej. W oparciu o cel badań czasami konieczne jest wyizolowanie genomowego DNA. Ponadto niektóre badania koncentrują się na izolacji plazmidowego DNA z bakterii. Izolacja genomowego DNA to proces izolacji genomowego DNA z próbki prokariotycznej lub eukariotycznej. Etapy izolacji różnią się w zależności od typu komórki, w której izolowane jest DNA. Izolacja plazmidowego DNA to proces izolacji plazmidowego DNA z komórki bakteryjnej. W porównaniu z izolacją genomowego DNA,cały proces jest złożony w izolacji plazmidowego DNA.