Kluczowa różnica między grupą wewnętrzną a grupą zewnętrzną w biologii polega na tym, że grupa wewnętrzna to grupa blisko spokrewnionych taksonów, które są badane pod kątem pokrewieństwa ewolucyjnego, podczas gdy grupa zewnętrzna jest grupą odniesienia lub taksonem spoza grupy zainteresowania i bardziej odlegle spokrewniona z grupą wewnętrzną.
Kladystyka lub filogenetyka to najczęściej stosowana metoda klasyfikacji biologicznej. Używa najnowszego wspólnego przodka, aby podzielić organizmy na grupy lub klady. Analiza kladystyczna ostatecznie tworzy kladogram, który jest diagramem w kształcie drzewa przedstawiającym relacje filogenetyczne między organizmami. Zatem kladystyka pomaga określić ewolucyjne relacje między gatunkami, zwłaszcza organizmami monofiletycznymi. Grupa zewnętrzna i grupa wewnętrzna to dwie grupy zdefiniowane w kladystyce. Grupa wewnętrzna to grupa taksonów, która jest badana w celu określenia zależności ewolucyjnych. Są to blisko spokrewnione taksony lub taksony siostrzane. Z kolei grupa zewnętrzna to grupa odniesienia, która znajduje się poza grupą zainteresowań. Grupa zewnętrzna jest odlegle związana z grupą wewnętrzną.