Kluczowa różnica - Ligaza DNA a polimeraza DNA
Ligaza DNA i polimeraza DNA to ważne enzymy zaangażowane w mechanizmy replikacji DNA i naprawy DNA organizmów. Ligaza DNA jest odpowiedzialna za łączenie fragmentów DNA poprzez katalizowanie tworzenia wiązań fosfodiestrowych między nukleotydami. Polimeraza DNA jest odpowiedzialna za syntezę DNA z jego bloków budulcowych (nukleotydów) przy użyciu matrycowego DNA. To jest kluczowa różnica między ligazą DNA a polimerazą DNA.
SPIS TREŚCI
1. Przegląd i kluczowe różnice
2. Co to jest ligaza DNA
3. Co to jest polimeraza DNA
4. Porównanie obok siebie - ligaza DNA i polimeraza DNA
5. Podsumowanie
Co to jest ligaza DNA?
Ligazy DNA enzym, który katalizuje tworzenie się wiązania fosfodiestrowego między 3' - i 5'-OH PO 4 grupach nukleotydów, który ułatwia łączenie fragmentów DNA. Jest również znany jako zszywacz molekularny. Zdolność ta umożliwia wypełnianie luk lub nacięć DNA oraz łączenie fragmentów Okazaki powstałych podczas replikacji DNA. Ligazy DNA są bardzo przydatne w technologii rekombinacji DNA do wytwarzania cząsteczek rekombinowanego DNA. Ligaza DNA łączy interesujący nas DNA z DNA wektora. Dlatego jest ważnym enzymem dla organizmów.
Funkcjonowanie enzymu ligazy DNA zależy od kofaktora i jonów Mg2 +. Istnieją dwa kofaktory, które pomagają w ligazach DNA. NAD + działa jako kofaktor dla bakteryjnych ligaz DNA, podczas gdy ATP często działa jako kofaktor wirus i eukariotyczne ligazy DNA. Działanie ligazy eukariotycznego DNA przebiega w trzech głównych etapach.
Krok 01. Ligaza DNA atakuje cząsteczkę ATP i uwalnia pirofosforan (dwie grupy fosforanowe) i AMP oraz tworzy ligazę-adenylan jako związek pośredni, wiążąc się kowalencyjnie z powstałym AMP.
Krok 02: Utworzony enzym AMP pośredni przenosi AMP na 5 'fosforan nici i tworzy DNA - adenylan (tlen 5'-fosforanowy nici DNA atakuje fosfor w związku pośrednim ligaza-adenylan).
Krok 03: Ligaza DNA katalizuje atak 3′-OH nacięcia na adenylanie DNA, aby połączyć się z polinukleotydami i uwolnić AMP.
Ligazy DNA są zwykle izolowane z bakteriofaga T4 i szeroko stosowane w technologii rekombinacji DNA.
Rysunek 01: Ligaza DNA w naprawie nici
Co to jest polimeraza DNA?
Polimeraza DNA jest wszechobecnym enzymem obecnym we wszystkich organizmach biorących udział w syntezie DNA i replikacji genomu. Informacja genetyczna jest przekazywana z rodzica na potomstwo przy pomocy polimeraz DNA. Katalizuje syntezę nowego DNA komplementarnego z istniejącym DNA. Polimeraza DNA dodaje nukleotydy (elementy budulcowe kwasów nukleinowych) do grupy 3 'OH sekwencji startera i kontynuuje tworzenie nici w kierunku 5'. Większość polimeraz DNA ma aktywność polimerazy od 5 'do 3' i aktywność egzonukleazy od 3 'do 5' do korekty.
Prokariotyczne polimerazy DNA opisano w pięciu głównych grupach. Eukarionty zawierają co najmniej 16 różnych polimeraz DNA. Wszystkie te polimerazy DNA są pogrupowane w siedem rodzin, a mianowicie A, B, C, D, X, Y i RT (odwrotna transkryptaza).
Rysunek 02: Replikacja DNA napędzana polimerazą DNA
Jaka jest różnica między ligazą DNA a polimerazą DNA?
Porównaj środek artykułu przed tabelą
Ligaza DNA a polimeraza DNA |
|
| Ligaza DNA jest enzymem, który katalizuje tworzenie wiązań fosfodiestrowych między nukleotydami i łączy ze sobą fragmenty DNA. | Polimeraza DNA jest enzymem, który katalizuje syntezę DNA przy użyciu nukleotydów. |
| Rola w replikacji DNA | |
| Ligaza DNA jest dodatkowym enzymem w replikacji DNA, który łączy fragmenty Okazaki. | Polimeraza DNA jest głównym enzymem w replikacji DNA. |
| Wymagania | |
| Zależy od jonów Mg 2+ i kofaktorów ATP / NAD + | Zależy to od szablonu, nukleotydów, starterów i Mg 2+. |
| Funkcje | |
| Ligaza DNA jest ważna dla rekombinacji DNA, naprawy DNA i replikacji DNA. | Polimeraza DNA jest ważna dla technologii replikacji, naprawy DNA i rekombinacji DNA. |
Podsumowanie - Ligaza DNA a polimeraza DNA
Ligaza DNA jest ważnym enzymem potrzebnym do łączenia fragmentów DNA wiązaniami fosfodiestrowymi. Polimeraza DNA jest głównym enzymem ważnym dla nowej syntezy DNA. Kluczową różnicą między ligazą DNA a polimerazą DNA jest ich funkcja. Jednak oba enzymy są niezbędne do naprawy DNA, replikacji DNA i technologii rekombinacji DNA.
