Kluczowa różnica między ruchami autonomicznymi i paratonicznymi polega na tym, że ruchy autonomiczne są reakcjami na bodziec generowany w roślinie przez geny, podczas gdy ruchy paratoniczne są reakcjami roślin na bodziec zewnętrzny bez udziału genów.
Rośliny reagują na bodźce zewnętrzne; reagują również na bodźce generowane w roślinie. Na tej podstawie istnieją dwa rodzaje ruchów: ruchy autonomiczne i ruchy paratoniczne. Ruchy autonomiczne są reakcjami wykazywanymi na niektóre przyczyny wewnętrzne, szczególnie z powodu zaangażowania genów. Natomiast ruchy paratoniczne są reakcjami wykazywanymi na bodźce zewnętrzne, takie jak ciepło, ciśnienie, woda, światło słoneczne itp. Ze względu na udział genów, ruchy autonomiczne roślin są obecne od urodzenia, w przeciwieństwie do ruchów paratonicznych.