Kluczowa różnica między atomami a cząstkami polega na tym, że atomy są małymi jednostkami złożonymi z kilku cząstek, podczas gdy cząsteczki to maleńkie części materii.
Atom jest najmniejszą jednostką całej materii. W przeszłości ludzie myśleli, że atom jest najmniejszą rzeczą, jaka istnieje i nie możemy go dalej rozłożyć. Jednak według ostatnich badań atom składa się z kilku małych cząstek zwanych cząstkami subatomowymi. Jednak termin cząstka w chemii odnosi się do każdego małego zlokalizowanego obiektu, który ma właściwości fizyczne, takie jak objętość, gęstość i masa.