Kluczowa różnica między myszami transgenicznymi a myszami knockout polega na tym, że myszy transgeniczne mają obce geny wstawione do swojego genomu, podczas gdy myszy z nokautem mają interesujący gen dezaktywowany funkcjonalnie.
Inżynieria genetyczna to dziedzina genetyki, w której skład genetyczny organizmu jest modyfikowany lub manipulowany za pomocą technologii rekombinacji DNA. Organizmy transgeniczne powstają poprzez wprowadzenie obcych genów (transgenów) do organizmów przy użyciu biotechnologii. Nazywa się je również organizmami modyfikowanymi genetycznie. Organizmy transgeniczne są cennymi narzędziami badawczymi. Są ważne w badaniu funkcji genu oraz w terapii genowej i rolnictwie. Myszy są używane jako modele zwierząt laboratoryjnych, ponieważ są bliżej spokrewnione z ludźmi. Myszy transgeniczne i myszy z nokautem to dwa typy zwierząt zmodyfikowanych genetycznie. U myszy transgenicznych DNA gospodarza w locus jest zastępowane inną wersją tego samego genu lub zupełnie innym genem. U myszy knockout gen gospodarza jest po prostu usuwany lub dezaktywowany funkcjonalnie.
