Jedną z kluczowych różnic między histologią a cytologią jest to, że histologia to dziedzina biologii, która bada tkanki zwierząt i roślin pod mikroskopem, podczas gdy cytologia to kolejna gałąź biologii, która bada komórki pod mikroskopem. Ponadto badania histologiczne są szersze, bardziej szczegółowe i droższe niż badania cytologiczne.
Każdy żywy organizm na ziemi składa się z komórki lub zbioru komórek, z wyjątkiem wirusów. Komórka to najmniejsza strukturalna i funkcjonalna jednostka organizmu. Tkanka to grupa komórek, które pełnią wspólną funkcję i mają podobne pochodzenie. Różne rodzaje tkanek współpracują ze sobą i tworzą narząd. Układ narządów to zbiór narządów. Podobnie, organizm zwierzęcy lub roślinny obejmuje różne poziomy organizacji o rosnącej złożoności każdego poziomu, od komórek po układy narządów i organizmy. W związku z tym organizmy jednokomórkowe mają proste struktury, podczas gdy większość organizmów wielokomórkowych ma bardzo złożone struktury. Histologia i cytologia to dwie gałęzie biologii, które badają tkanki zwierząt, roślin i komórek pod mikroskopem.