Kluczową różnicą między homozygotą a heterozygotą jest to, że homozygotyczny oznacza, że oba allele są podobne dla cechy, podczas gdy heterozygotyczny oznacza, że dwa allele są różne dla cechy.
Geny odziedziczone z chromosomów rodzicielskich kontrolują wszystkie postacie lub cechy zwierząt, roślin i wszystkich innych żywych istot. Jest to główny powód przejawiania cech rodzicielskich u potomstwa. Większość organizmów eukariotycznych ma dwa zestawy genów, znane jako geny matki i geny ojca. Dlatego sytuacja genetyczna jest znana jako diploidalna (dwa zestawy chromosomów). To znaczy; wszystkie cechy mają składniki genetyczne zarówno od matki, jak i od ojca. Jednak te geny mogą być albo dominujące, albo recesywne względem siebie nawzajem i właśnie wtedy cechy homozygotyczne i heterozygotyczne stają się ważne. Homozygotyczny to stan posiadania dwóch dominujących alleli (AA) lub dwóch recesywnych alleli (aa), podczas gdy heterozygotyczny to stan posiadania jednego dominującego allelu i jednego recesywnego allelu (Aa).