Kluczową różnicą między sygnalizacją wewnątrzkomórkową i międzykomórkową jest to, że sygnalizacja wewnątrzkomórkowa to komunikacja wewnątrz komórki, podczas gdy sygnalizacja międzykomórkowa to komunikacja między komórkami.
Komórki uwalniają cząsteczki sygnałowe do komórek docelowych i komunikują się ze sobą za pośrednictwem cząsteczek sygnałowych w organizmach wielokomórkowych. Komórki docelowe mają receptory na swoich powierzchniach komórkowych iw cytoplazmie, aby odbierać sygnały i odpowiednio działać. Ponadto w komórce zachodzi komunikacja między organellami a jądrem w celu pełnienia funkcji komórkowych. Dlatego istnieją dwa typy komunikacji komórkowej, takie jak sygnalizacja wewnątrzkomórkowa lub komunikacja oraz komunikacja lub sygnalizacja międzykomórkowa.