Kluczowa różnica między klirensem kreatyniny a GFR polega na rodzaju testu, który pomaga analizować każdy pomiar. Analiza klirensu kreatyniny odbywa się poprzez badanie moczu, a analiza GFR poprzez badanie krwi.
Zdrowie nerek zależy od sprawności i dokładności ich funkcjonowania. Dlatego trzy główne etapy tworzenia moczu są niezbędne dla zdrowia nerek. Trzy główne etapy to ultrafiltracja, selektywna reabsorpcja i wydzielanie cewkowe. Ultrafiltracja zachodzi w kłębuszku kłębuszkowym, a zarówno klirens kreatyniny, jak i GFR mają związek z wydajnością procesu ultrafiltracji.