Kluczową różnicą między allogamią a autogamiią jest to, że allogamia to połączenie gamet męskich i żeńskich, które pochodzą od dwóch różnych osób, podczas gdy autogamia jest połączeniem gamet męskich i żeńskich tej samej osoby. Inną różnicą między allogamią a autogamiią w odniesieniu do wyprodukowanego potomstwa jest to, że allogamia daje potomstwo różniące się genetycznie, podczas gdy autogamia daje potomstwo identyczne pod względem genetycznym.
Fuzja męskiej gamet z żeńską to zapłodnienie. Zygota rozwija się w wyniku zapłodnienia, a następnie ulega podziałowi komórkowemu, aby wydać nowe potomstwo. Ponadto nawożenie może być dwojakiego rodzaju; samozapłodnienie lub zapłodnienie krzyżowe. Allogamia jest synonimem zapłodnienia krzyżowego, a autogamia jest synonimem samozapłodnienia.
