Kluczową różnicą między aminokwasami hydrofobowymi i hydrofilowymi jest to, że hydrofobowe aminokwasy są niepolarne, podczas gdy hydrofilowe są polarne.
Aminokwasy są budulcem białek. Białko to gigantyczna cząsteczka polimeru, która jest niezbędnym składnikiem wszystkich żywych organizmów. Ponadto aminokwasy występują głównie w dwóch typach, jako aminokwasy niezbędne i nieistotne. Ponadto możemy je zaliczyć do aminokwasów hydrofilowych i hydrofobowych w zależności od ich charakteru fizykochemicznego. Różnią się one od siebie głównie biegunowością.