Kluczową różnicą między elektroforezą żelową 1D i 2D są właściwości stosowane do rozdzielania białek w elektroforezie żelowej. Elektroforeza żelowa 1D rozdziela białka tylko na podstawie masy cząsteczkowej, podczas gdy elektroforeza żelowa 2D rozdziela białka na podstawie ich punktu izoelektrycznego i masy cząsteczkowej.
Rozdział białek metodą elektroforezy żelowej jest ważną techniką charakteryzowania białek. Białka mają różne właściwości; dlatego rozdział jest bardziej złożony w porównaniu z rozdziałem DNA metodą elektroforezy w żelu agarozowym.
