Kluczowa różnica - elektroforeza żelowa a strona SDS
Elektroforeza żelowa to technika polegająca na rozdzielaniu makrocząsteczek w polu elektrycznym. Jest to powszechna metoda w biologii molekularnej polegająca na oddzieleniu DNA, RNA i białek z mieszanin według ich wielkości molekularnych. Strona SDS to rodzaj elektroforezy żelowej, która służy do oddzielania białek od mieszaniny białek na podstawie ich wielkości. Elektroforeza żelowa to termin używany w odniesieniu do normalnej techniki stosowanej do rozdzielania DNA, RNA i białek, podczas gdy SDS Page to jeden rodzaj elektroforezy żelowej. To jest kluczowa różnica między elektroforezą żelową a SDS Page.
SPIS TREŚCI
1. Przegląd i kluczowe różnice
2. Czym jest elektroforeza żelowa
3. Co to jest SDS Strona
4. Porównanie obok siebie - elektroforeza żelowa a SDS Strona
5. Podsumowanie
Co to jest elektroforeza żelowa?
Elektroforeza żelowa jest powszechną techniką stosowaną w laboratoriach do oddzielania naładowanych cząsteczek, takich jak DNA, RNA, białka itp. Z ich mieszanin. W elektroforezie żelowej stosuje się żel. Działa jak sito molekularne. Istnieją dwa rodzaje żeli stosowanych w elektroforezie żelowej, a mianowicie agaroza i poliakryloamid. Wybór żelu i preparatu żelu są ważnymi czynnikami, które należy wziąć pod uwagę podczas elektroforezy żelowej, ponieważ wielkość porów żelu należy ostrożnie manipulować, aby dobrze rozdzielić cząsteczki za pomocą elektroforezy żelowej. Elektroforeza żelowa polega na podłączeniu pola elektrycznego do dwóch końców żelu. Jeden koniec żelu wykazuje ładunek dodatni, podczas gdy drugi koniec jest naładowany ujemnie.
DNA i RNA to cząsteczki naładowane ujemnie. Po załadowaniu do żelu z ujemnego końca żelu i przyłożeniu do pola elektrycznego migrują przez pory żelu w kierunku dodatnio naładowanego końca żelu. Szybkość migracji zależy od ładunku i wielkości cząsteczki. Mniejsze cząsteczki łatwo migrują przez pory żelu niż większe cząsteczki. W związku z tym mniejsze cząsteczki przemieszczają się na dużą odległość przez żel, a większe cząsteczki na krótką odległość. Aby obserwować przemieszczanie się cząsteczek na żelu, stosuje się specjalne rodzaje barwników. Pole elektryczne jest przykładane przez pewien czas i zatrzymywane, aby zapobiec utracie cząsteczek i utrzymać cząsteczki w ich przemieszczanych pozycjach. W żelu można zaobserwować różne prążki. Te prążki reprezentują cząsteczki o różnych rozmiarach. W związku z tym,elektroforeza żelowa jest przydatna do różnicowania cząsteczek według ich wielkości.
Elektroforeza żelowa jest włączana do różnych technik jako technika preparatywna w biologii molekularnej, takich jak PCR, RFLP, klonowanie, sekwencjonowanie DNA, Southern blotting, mapowanie genomu itp.
Rysunek 01: Elektroforeza w żelu agarozowym
Co to jest strona SDS?
Elektroforeza w żelu poliakryloamidowym z dodecylosiarczanem sodu (strona SDS) to rodzaj elektroforezy żelowej stosowanej do rozdzielania białek. Gdy do rozdzielania białek stosuje się elektroforezę żelową, potrzebne są specjalne zabiegi, ponieważ białka nie są naładowane ujemnie jak DNA i RNA i nie migrują w kierunku końca dodatniego lub ujemnego. W związku z tym białka są denaturowane i powlekane ładunkiem ujemnym przed elektroforezą żelową. Odbywa się to przy użyciu detergentu o nazwie dodecylosiarczan sodu (SDS). Elektroforeza żelowa, w której stosuje się SDS i żel poliakrylamidowy jako podłoże nośne, jest znana jako SDS Page. Technika ta jest powszechnie stosowana w biochemii, genetyce, medycynie sądowej i biologii molekularnej.
Podczas strony SDS białka są mieszane z SDS. SDS rozwija białka do kształtu liniowego i pokrywa je ładunkiem ujemnym proporcjonalnym do ich masy cząsteczkowej. Ze względu na ładunek ujemny cząsteczki białka migrują w kierunku dodatniego końca żelu i rozdzielają się zgodnie ze swoimi masami cząsteczkowymi. Na stronie SDS poliakrylamid jest używany jako stałe podłoże dla żelu. Rzeczywista separacja białek zależy głównie od właściwości żelu. Stąd przygotowanie żelu poliakryloamidowego powinno być starannie wykonane i należy stosować odpowiednie stężenia poliakryloamidu. Żele poliakrylamidowe wykazują wysoką rozdzielczość niż żele agarozowe. Dlatego SDS Page jest uważana za technikę o wysokiej rozdzielczości do separacji białek.
Strona SDS to rodzaj elektroforezy w żelu denaturującym. Ma poważne ograniczenie w analizie białka. Ponieważ SDS denaturuje białka przed separacją, nie pozwala na wykrycie aktywności enzymatycznej, interakcji wiązania białek, kofaktorów białek itp.
Rysunek 02: Strona SDS
Jaka jest różnica między elektroforezą żelową a stroną SDS?
Elektroforeza żelowa a strona SDS |
|
| Elektroforeza żelowa to metoda przeprowadzana w celu rozdzielenia makrocząsteczek za pomocą pola elektrycznego. | SDS Page to technika elektroforezy żelowej o wysokiej rozdzielczości, stosowana do rozdzielania białek na podstawie ich masy. |
| Gel Run | |
| Można go wykonać w poziomie lub w pionie. | Strona SDS zawsze biegnie pionowo. |
| Podstawa separacji | |
| Separacja następuje w zależności od ładunku i rozmiaru. | Separacja białek zachodzi w zależności od masy i ładunku. |
| Rozkład | |
| Elektroforeza w żelu agarozowym ma niską rozdzielczość, a elektroforeza w żelu poliakrylamidowym ma wyższą rozdzielczość | Strona SDS ma lepszą rozdzielczość. |
| Denaturacja | |
| Elektroforeza żelowa obejmuje zarówno techniki denaturujące, jak i niedenaturujące. | SDS Page denaturuje białka przed separacją. |
Podsumowanie - elektroforeza żelowa a strona SDS
Elektroforeza żelowa jest powszechną techniką stosowaną do rozdziału i analizy DNA, RNA i białek na podstawie ich wielkości i ładunku. Istnieją dwa główne rodzaje elektroforezy żelowej, mianowicie elektroforeza w żelu agarozowym i elektroforeza w żelu poliakryloamidowym. Żele agarozowe są używane głównie do separacji kwasów nukleinowych; gdy wymagana jest wyższa rozdzielczość, stosuje się żele poliakryloamidowe. Strona SDS to rodzaj elektroforezy żelowej powszechnie stosowanej do rozdzielania złożonych mieszanin białek. Uważa się, że jest to technika separacji białek o wysokiej rozdzielczości. To jest różnica między elektroforezą żelową a SDS Page.
