Kluczowa różnica między porynami a akwaporynami polega na tym, że poriny to wypełnione wodą pory i kanały znajdujące się w błonach bakterii i eukariotów. Tymczasem akwaporyny to białka błonowe, które tworzą selektywne względem wody kanały w żywych komórkach.
Różne cząsteczki wchodzą i wychodzą z komórki przez błonę plazmatyczną organizmów żywych. Tak więc w błonie komórkowej znajdują się różne białka błonowe, które utrzymują i regulują cząsteczki wchodzące i wychodzące z komórek. Poriny i akwaporyny to dwa takie typy białek błonowych. Spośród nich poriny to pory wypełnione wodą, które ułatwiają transport cząsteczek hydrofilowych przez membranę. Tymczasem akwaporyny to kanały selektywne względem wody, które umożliwiają swobodny przepływ wody przez membranę.
