Kluczowa różnica między białkiem regulatorowym a represorowym polega na tym, że białko regulatorowe może promować lub hamować transkrypcję genów. Tymczasem białko represorowe hamuje ekspresję jednego lub większej liczby genów.
Zanim przejdziemy dalej do dyskusji na temat różnicy między białkiem regulatorowym i represorowym, omówmy pokrótce regulację genów. Gen to specyficzna sekwencja nukleotydów, w której ukryta jest informacja genetyczna w celu syntezy białka. Ekspresję genów można regulować na różne sposoby. Poprzez różne mechanizmy komórki kontrolują ekspresję genów i ich poziomy ekspresji. Ogólnie rzecz biorąc, regulacja genów zachodzi na poziomie transkrypcji. Białko regulatorowe i białko represorowe to dwa rodzaje białek zaangażowanych w regulację genów na poziomie transkrypcji. Te białka regulatorowe i białka represorowe wiążą się z określoną sekwencją w pobliżu genu i wpływają na transkrypcję genu.