Kluczowa różnica między snRNA i snRNP polega na tym, że snRNA to małe jądrowe cząsteczki RNA, podczas gdy snRNP lub małe jądrowe rybonukleoproteiny to małe jądrowe cząsteczki RNA z białkami.
snRNA to niekodujące, biologicznie aktywne małe cząsteczki RNA o średniej wielkości 150 nukleotydów. Zwykle występują w połączeniu z białkami jako snRNP w stanie naturalnym. Dlatego snRNP to małe jądrowe RNA z kilkoma białkami specyficznymi dla snRNP. snRNP biorą udział w pośredniczeniu lub regulowaniu potranslacyjnych zdarzeń przetwarzania RNA, takich jak splicing itp. Zarówno snRNA, jak i snRNP znajdują się w jądrach komórek eukariotycznych.