Kluczowa różnica między transpozonami kompozytowymi i niekompozytowymi polega na tym, że transpozony złożone mają dwie flankujące sekwencje insercyjne, podczas gdy transpozony niekompozytowe mają odwrócone powtórzenia zamiast flankujących sekwencji insercyjnych.
Transpozon to fragment DNA, który może przemieszczać się w obrębie genomu bakterii. Są to ruchome sekwencje DNA. Przenoszą się w nowe lokalizacje genomu. Ruchy te powodują zmiany w sekwencji genomu bakterii, powodując istotne zmiany informacji genetycznej. Są to transpozycyjne elementy genetyczne odpowiedzialne za tworzenie nowych sekwencji genetycznych u bakterii. Transpozony są również określane jako skaczące geny, ponieważ te skaczące sekwencje mogą blokować transkrypcję genów i reorganizować materiał genetyczny bakterii. Ponadto są odpowiedzialne za przemieszczanie się genów oporności na leki, antybiotyki między plazmidami i chromosomami. Istnieją dwa rodzaje transpozonów: transpozony złożone i niekompozytowe.
