Kluczową różnicą między chorobą Pageta a egzemą jest to, że choroba Pageta jest ogniskowym zaburzeniem przebudowy kości, a wyprysk jest stanem zapalnym skóry charakteryzującym się grupami zmian pęcherzykowych o różnym stopniu wysięku i łuszczenia.
Choroba Pageta występuje z powodu mutacji w pewnych genach, takich jak czynnik jądrowy kappa B, sekwestosom p62 i osteoprotegeryna. Z drugiej strony, wyprysk występuje w wyniku reakcji nadwrażliwości na różne alergeny. Ta różnica w patogenezie jest główną różnicą między tymi dwiema chorobami.