Kluczowa różnica między chemią medyczną a chemią farmaceutyczną polega na tym, że chemia medyczna zajmuje się projektowaniem, optymalizacją i opracowywaniem nowych związków chemicznych w celu ich wykorzystania jako leków, podczas gdy chemia farmaceutyczna zajmuje się badaniem leków i ich opracowywaniem.
Zarówno chemia lecznicza, jak i farmaceutyczna zajmują się lekami lub lekami, których używamy do leczenia różnych chorób. Obie te dziedziny omawiają projektowanie i rozwój leków z bardzo niewielkimi różnicami. Jedną z takich różnic jest to, że chemia medyczna bada nie tylko leki, ale także mechanizmy działania tych leków w naszym organizmie.