Kluczowa różnica między biologią kwantową a chemią polega na tym, że biologia kwantowa jest nową dyscypliną naukową, która obejmuje zastosowanie mechaniki kwantowej i chemii teoretycznej do aspektów biologii, podczas gdy chemia jest nauką badającą skład, strukturę i właściwości materii.
Biologia kwantowa i chemia to dwie gałęzie nauki. Biologia kwantowa to zastosowanie mechaniki kwantowej w procesach biologicznych. Chemia zajmuje się właściwościami, składem i strukturą substancji oraz ich przemianami. Dlatego chemia bada materię, podczas gdy biologia kwantowa koncentruje się na procesach biologicznych o charakterze mechaniki kwantowej.