Kluczową różnicą między indukowanym dopasowaniem a blokowaniem i kluczem jest to, że w teorii indukowanego dopasowania wiązanie substratu z miejscem aktywnym enzymu indukuje modyfikację kształtu miejsca aktywnego w komplementarny kształt substratu. Natomiast w teorii zamka i klucza substrat i miejsce aktywne enzymu mają na początku komplementarny kształt.
Enzymy są katalizatorami reakcji metabolicznych. Dlatego są specyficzne dla swoich podłoży. Substrat wiąże się z miejscem aktywnym enzymu, a następnie przekształca się w produkt. Dwie hipotezy, a mianowicie hipoteza indukowanego dopasowania oraz hipoteza zamka i klucza, wyjaśniają to wiązanie substratu do enzymu.
