Kluczowa różnica między allelem a locus polega na tym, że allel odnosi się do jednej z dwóch lub więcej alternatywnych sekwencji genu w określonym locus, podczas gdy locus odnosi się do określonej lokalizacji na chromosomie, w której można znaleźć gen.
W postaci genów informacje genetyczne dziedziczą od rodziców do potomstwa. Geny to specyficzne sekwencje nukleotydowe zlokalizowane w chromosomach. W genomie organizmu można znaleźć wiele genów. Ich rozmieszczenie w genomie jest precyzyjne, a lokalizację genu można łatwo znaleźć za pomocą markera genetycznego. Ponadto określony gen może mieć różne wersje, które nazywamy allelami. Bardzo ważna jest również specyficzna lokalizacja genu w chromosomie i nazywamy to locus.
