Kluczowa różnica między aparatem szparkowym a komórkami ochronnymi polega na tym, że aparaty szparkowe to pory, które znajdują się na naskórku liści, łodyg itp., Podczas gdy komórki ochronne to komórki, które otaczają i regulują otwieranie i zamykanie aparatów szparkowych.
Oddychanie i fotosynteza to dwa ważne procesy zachodzące w roślinach. W obu procesach ważna jest wymiana gazowa. Komórki szparkowe i ochronne ułatwiają wymianę gazową w roślinach. Tutaj komórki ochronne są komórkami miąższu i są to komórki otaczające aparaty szparkowe. Komórki ochronne kontrolują transpirację, która jest podstawowym procesem roślin, które zapewniają zdrowie roślin. Ponadto komórki ochronne zawierają chlorofile. W związku z tym są również zdolne do fotosyntezy.