Kluczową różnicą między bioreaktorem a fermentorem jest rodzaj reakcji biochemicznej, która zachodzi w zamkniętych naczyniach. Bioreaktor ułatwia wszystkie rodzaje reakcji biochemicznych, ale fermentor jedynie ułatwia fermentację.
Zastosowanie biotechnologii w przemyśle to ciekawa dziedzina nauki. Zastosowania te różnią się od zastosowań mikrobiologicznych do zastosowań na zwierzętach. Ponadto zastosowania przemysłowe biotechnologii różnią się w głównych obszarach, takich jak rolnictwo, medycyna i różne gałęzie przemysłu. Bioreaktory to zamknięte naczynia, w których stwarza się warunki niezbędne do ułatwienia różnego rodzaju reakcji biochemicznych. Fermentory należą do grupy bioreaktorów, ale przede wszystkim służą wyłącznie do przeprowadzania fermentacji.
