Kluczowa różnica między aminokwasem a nukleotydem polega na tym, że aminokwas jest budulcem białek, podczas gdy nukleotyd jest budulcem kwasów nukleinowych.
Makrocząsteczka to duża cząsteczka powstająca w wyniku polimeryzacji jej monomerów. Najpowszechniejszymi makrocząsteczkami występującymi w organizmach żywych, w tym roślinach, są kwasy nukleinowe (DNA i RNA), białka, lipidy, węglowodany itp. Wśród różnych makrocząsteczek białka i kwasy nukleinowe są niezbędne dla przetrwania organizmów. Aminokwasy i nukleotydy są odpowiednio elementami budulcowymi białek i kwasów nukleinowych. Obie są cząsteczkami organicznymi i występują w dużych stężeniach wewnątrz komórek.