Kluczową różnicą między nukleotydem a nukleozydem jest to, że nukleotyd zawiera grupę fosforanową, podczas gdy nukleozyd nie ma grupy fosforanowej.
Nukleozydy i nukleotydy to podobny typ cząsteczek, które różnią się niewielką zmianą strukturalną. Zarówno nukleotyd, jak i nukleozyd składają się z tych samych dwóch składników; cukier pentozowy i baza azotowa. Dodatkowo nukleotyd ma jedną lub więcej grup fosforanowych. Stąd, poprzez dodanie grupy fosforanowej, nukleozyd może zostać przekształcony w nukleotyd przez enzymy zwane kinazą. Nukleotyd jest budulcem kwasów nukleinowych. Z drugiej strony nukleozydy są dobrymi substancjami przeciwnowotworowymi i przeciwwirusowymi.