Kluczową różnicą między receptorami AMPA i NMDA jest to, że specyficznym agonistą receptora AMPA jest kwas alfa-amino - 3 - hydroksy - 5 - metylo - 4 - izoksazolo-propionowy (AMPA), podczas gdy specyficznym agonistą receptora NMDA jest kwas N - metylowy. - D - asparaginian (NMDA).
Istnieją trzy główne typy receptorów glutaminianu. Różnica polega na tym, że agonista wiąże aktywację receptora wiążącego glutaminian. Wiązanie glutaminianu spowoduje otwarcie kanałów bramkowanych jonami do transportu jonów sodu i potasu. Receptory NMDA również ułatwiają przepływ jonów wapnia przez błonę.
