Kluczowa różnica między liniowymi i obrotowymi silnikami molekularnymi polega głównie na ruchu kompleksów tworzących białko motoryczne. Podczas gdy liniowe silniki molekularne wykazują jednokierunkowy ruch liniowy między kompleksami, obrotowe silniki molekularne wykazują ruchy obrotowe wokół różnych kompleksów tworzących silnik molekularny.
Silniki molekularne są ważnymi biomolekułami, które biorą udział w wielu reakcjach, szczególnie związanych z wytwarzaniem energii w postaci trójfosforanu adenozyny (ATP). Odgrywają kluczową rolę w ruchu lub pracy mechanicznej. Białka motoryczne wykorzystują darmową energię z hydrolizy ATP lub trifosforanu nukleotydów w celu wytworzenia siły mechanicznej. Istnieją dwa typy silników molekularnych: liniowe i obrotowe. Reprezentują dwa tryby pracy silnika.
