Kluczową różnicą między cichą a neutralną mutacją jest to, że cicha mutacja jest specyficznym typem neutralnej mutacji, która nie ma obserwowalnego wpływu na fenotyp organizmu, podczas gdy mutacja neutralna jest zmianą w sekwencji DNA, która nie jest ani korzystna, ani szkodliwa dla zdolności organizm do przetrwania i rozmnażania się.
Mutacja to zmiana, która zachodzi w sekwencji nukleotydów DNA. Mutacja może nastąpić z powodu czynników środowiskowych, takich jak dym papierosowy i światło UV lub z powodu ataków wirusów, silnych chemikaliów itp. Mutacje w komórkach linii płciowej przechodzą do następnych pokoleń, podczas gdy mutacje w komórkach innych niż komórki rozrodcze (mutacje somatyczne) nie przechodzą w następne pokolenia i wpłyną na przetrwanie pojedynczego organizmu. Ciche mutacje nie powodują zmian w sekwencji aminokwasowej kodowanego białka. Mutacje neutralne nie wywierają obserwowalnego wpływu na fenotyp organizmu.
