Kluczowa różnica między systemem plików a bazą danych polega na tym, że system plików zarządza tylko dostępem fizycznym, podczas gdy baza danych zarządza zarówno fizycznym, jak i logicznym dostępem do danych.
Baza danych i system plików to dwie metody, które pomagają w przechowywaniu, pobieraniu, zarządzaniu i manipulowaniu danymi. Oba systemy pozwalają użytkownikowi pracować z danymi w podobny sposób. System plików to zbiór surowych plików danych przechowywanych na dysku twardym, podczas gdy baza danych jest przeznaczona do łatwego organizowania, przechowywania i odzyskiwania dużych ilości danych. Innymi słowy, baza danych zawiera zbiór uporządkowanych danych, zwykle w postaci cyfrowej dla jednego lub większej liczby użytkowników. Skrót z bazy danych to DB. Istnieje możliwość sklasyfikowania bazy danych według ich zawartości, np. Tekstu dokumentu, bibliografii i statystyki. Należy zauważyć, że nawet w bazie danych dane są ostatecznie lub fizycznie przechowywane w niektórych plikach.