Kluczowa różnica między mikrofagami a makrofagami polega na tym, że mikrofag to rodzaj małego fagocytu żyjącego tylko przez kilka dni, podczas gdy makrofag jest rodzajem większego fagocytu o dłuższej żywotności.
Nasz układ odpornościowy walczy z atakującymi patogennymi mikroorganizmami i zapewnia nam bezpieczeństwo. Stąd jest to złożony system, który wykonuje wiele różnych mechanizmów obronnych w celu wykrycia najeźdźców i ich zniszczenia. Fagocytoza to jeden z mechanizmów, w którym fagocyty pochłaniają atakujące cząsteczki i zabijają je. Fagocyty to komórki zdolne do pochłaniania i wchłaniania bakterii, a inne obce komórki i zakaźne cząsteczki niszczą w nich. W związku z tym istnieją dwa główne typy fagocytów, mianowicie mikrofagi i makrofagi. Mikrofag to mały polimorfojądrowy fagocyt, który występuje w dużych ilościach. Z drugiej strony makrofagi to rodzaj fagocytów, który stacjonuje w kilku ważnych miejscach w naszym ciele, aby działać jako frontowy mechanizm obronny przed najeżdżającymi cząstkami. Są dużymi zjadaczami w naszym układzie odpornościowym.