Kluczowa różnica między rybozymami i enzymami białkowymi polega na tym, że rybozymy to cząsteczki RNA, które są zdolne do katalizowania pewnych specyficznych reakcji biochemicznych, podczas gdy enzymy białkowe są cząsteczkami białek, które są zdolne do katalizowania większości reakcji biochemicznych zachodzących w żywych organizmach.
Enzymy są biologicznymi katalizatorami i przyspieszają tempo reakcji biochemicznych. Ogólnie wszystkie enzymy są białkami zbudowanymi z aminokwasów. Dlatego nazywane są również enzymami białkowymi. Istnieją jednak określone cząsteczki RNA, które mogą działać jako katalizatory określonych reakcji biochemicznych. Są to rybozymy lub enzymy kwasu rybonukleinowego. Dlatego zarówno rybozymy, jak i enzymy białkowe pełnią tę samą funkcję, jaką jest katalizowanie reakcji biochemicznych.
