Kluczowa różnica między antygenem a przeciwciałem polega na tym, że antygen to każda substancja, która pobudza układ odpornościowy do wytwarzania przeciwciał przeciwko niemu, podczas gdy przeciwciało jest białkiem ochronnym immunoglobuliny w kształcie litery Y, które jest zdolne do wiązania się z antygenami w celu ich zneutralizowania.
Podstawowa wiedza na temat immunologii, a także niektórych aspektów mikrobiologii, patologii i dermatologii, opiera się na zrozumieniu podstawowych pojęć dotyczących reakcji antygen-przeciwciało. Są to elementy składowe rozległych baz wiedzy i nowo opracowywanych technologii zwalczania różnych ilości chorób.