Kluczowa różnica między prowirusem a retrowirusem polega na tym, że prowirus jest etapem replikacji wirusa, który pokazuje zintegrowany stan genomu wirusa z genomem gospodarza, podczas gdy retrowirus jest wirusem RNA, który ma zdolność przekształcania swojego genomu RNA w pośredni DNA przez enzym odwrotną transkryptazę.
Wirusy to małe zakaźne cząsteczki, które są w stanie replikować się w żywym organizmie. Dlatego są obligatoryjnymi pasożytami wewnątrzkomórkowymi. Mogą zakażać prawie wszystkie organizmy żywe, w tym zwierzęta, rośliny, grzyby, pierwotniaki i bakterie. W ten sposób są przyczyną wielu śmiertelnych chorób, w tym HIV, polio, różyczki, zapalenia wątroby itp. Ponadto są to mikroskopijne cząsteczki złożone z kapsydów białkowych i genomu DNA lub RNA. Ich genom może być jednoniciowy lub dwuniciowy, kołowy lub liniowy. Retrowirus to grupa wirusów. Wirusy te posiadają genom jednoniciowego RNA o dodatniej czułości i geny kodujące enzym odwrotnej transkryptazy. W związku z tym są zdolne do replikacji poprzez półprodukt DNA. Natomiast prowirus jest etapem replikacji wirusa.
