Kluczowa różnica między sekwencją konserwatywną a sekwencją konsensusową polega na tym, że sekwencja konserwowana odnosi się do podobnych sekwencji kwasów nukleinowych lub aminokwasów, które występują w różnych lub tych samych gatunkach przez pokolenia, podczas gdy sekwencja konsensusowa jest powszechnie spotykaną sekwencją nukleotydową lub sekwencją aminokwasową znajdującą się w wysoce konserwatywnym regionie DNA lub RNA lub białka.
Organizmy mają podobne, jak również różne cechy. Podczas badania relacji między organizmami i ich klasyfikacji bardzo ważny jest genom lub skład genetyczny organizmów. Istnieją pewne sekwencje nukleotydów lub aminokwasów, które są wspólne dla różnych organizmów. Sekwencja konserwatywna to sekwencja kwasu nukleinowego lub aminokwasowa, która jest spójna u różnych gatunków. Dlatego mają znaczenie filogenetyczne przy tworzeniu drzew filogenetycznych. W sekwencjach konserwowanych istnieją specyficzne sekwencje nukleotydowe, które są częściej spotykane. Są znane jako sekwencje konsensusu.
