Kluczowa różnica między konfiguracją R i S polega na tym, że konfiguracja R jest przestrzennym rozmieszczeniem izomeru R, który ma swój względny kierunek kolejności priorytetów w kierunku zgodnym z ruchem wskazówek zegara, podczas gdy konfiguracja S jest przestrzennym rozmieszczeniem izomeru S, który ma swój względny kierunek pierwszeństwa kolejność w kierunku przeciwnym do ruchu wskazówek zegara. Tutaj względny kierunek kolejności pierwszeństwa jest malejącym porządkiem pierwszeństwa podstawników.
Izomery R i S to cząsteczki organiczne posiadające centrum chiralności, którym jest atom węgla, do którego przyłączone są cztery różne podstawniki. Te podstawniki są wymienione zgodnie z ich priorytetem (priorytet jest określany przy użyciu reguł CIP, jak opisano poniżej).
