Kluczową różnicą między podchlorynem wapnia a podchlorynem sodu jest to, że podchloryn wapnia zawiera dwa aniony podchlorynu związane z jednym kationem wapnia, podczas gdy podchloryn sodu zawiera jeden anion podchlorynu związany z jednym kationem sodu. Z wyglądu podchloryn wapnia ma barwę od białej do szarej, podczas gdy podchloryn sodu jest zielonkawożółtą substancją stałą o słodkim zapachu.
Podchloryn wapnia i sodu to związki jonowe zawierające kation metalu i anion pochodzący z chloru. Liczba anionów na kation tych związków różni się od siebie wartościowością kationu metalu.
