Kluczową różnicą między jajnikiem a zalążkiem jest to, że jajnik jest częścią żeńskiej struktury rozrodczej, która rozwija się w owoc roślin kwitnących, podczas gdy zalążek jest strukturą, która rozwija się w nasiona roślin nasiennych.
Kwiat to struktura reprodukcyjna roślin kwiatowych. Niektóre kwiaty są idealne, a inne niedoskonałe. Doskonałe kwiaty zawierają zarówno męską, jak i żeńską część rozrodczą, odpowiednio, androecium i gynoecium. Gynoecium ma trzy główne składniki, a mianowicie piętno, styl i jajnik. W związku z tym jajnik jest strukturą zawierającą zalążki. Możemy go znaleźć u podstawy ginekologii. Zatem zalążki są strukturami zawierającymi żeńskie komórki rozrodcze lub komórki jajowe. Jajnik otacza zalążki w okresie kwitnienia. Jeden jajnik może zawierać wiele zalążków, ale jeden zalążek często zawiera jedną komórkę jajową (gametę żeńską). Po zapłodnieniu jajnik i zalążek rozwijają się w różne struktury owocu.