Kluczowa różnica między nefrydiami a kanalikami malpighia zależy od ich występowania w organizmach. Nefrydy są obecne w organizmach niższych, takich jak robaki i mięczaki, podczas gdy kanaliki malpighia są obecne w tylnych obszarach owadów i stawonogów lądowych.
Wydalanie jest ważnym aspektem żywych organizmów. Szlaki metaboliczne generują różne produkty wydalnicze jako produkty uboczne. Jednak nagromadzenie odpadów w organizmie żywego organizmu jest toksyczne i szkodliwe. Dlatego obecność mechanizmu usuwania odpadów metabolicznych z organizmu poprzez system wydalania jest koniecznością. Stąd różne typy narządów wydalniczych występują w różnych grupach organizmów. Nefrydia i kanaliki malpighia to dwa przykłady takich narządów wydalniczych.
