Kluczowa różnica między chemotaksją a fagocytozą polega na tym, że chemotaksja jest ukierunkowaną migracją komórek lub organizmu wzdłuż chemicznego gradientu stężenia, podczas gdy fagocytoza jest mechanizmem pochłaniającym obce cząsteczki zakaźne w celu ich zneutralizowania lub zniszczenia.
Leukocyty to ważne komórki układu odpornościowego. To białe krwinki. Niektóre leukocyty są fagocytami. Fagocyty wykorzystują fagocytozę do pochłaniania obcych cząstek. Przykładami fagocytów są monocyty, neutrofile i makrofagi. Aby dotrzeć do antygenów lub obcych cząstek, fagocyty stosują chemotaksję. Chemotaksja to ruch komórek lub organizmów w kierunku lub od bodźców chemicznych. Ponadto fagocyty i komórki odpornościowe mobilizują się do miejsca zakażenia, uszkodzenia tkanki i reakcji immunologicznej poprzez chemotaksję.