Kluczowa różnica między allelopatią a antybiozą polega na rodzaju efektu wywoływanego przez każde zjawisko. Allelopatia ma zarówno pozytywny, jak i negatywny wpływ na relacje między dwoma lub więcej organizmami, podczas gdy antybioza wywiera negatywny wpływ na jeden z organizmów zaangażowanych w związek.
Odżywianie odgrywa ważną rolę w przetrwaniu organizmów. W tym kontekście związek między organizmami w zakresie zapotrzebowania na składniki odżywcze ma kluczowe znaczenie. Zarówno allelopatia, jak i antybioza to związki zachodzące między dwoma lub więcej organizmami. Jednak reagują na siebie w różnych formach.