Kluczowa różnica między FISH i CGH polega na tym, że FISH to technika molekularna, która wykrywa określoną sekwencję DNA na chromosomie przy użyciu sond znakowanych fluorescencyjnie, podczas gdy CGH to kolejna technika cytogenetyczna molekularna, która wykrywa zmiany w genomowym DNA.
Analiza cytogenetyczna odgrywa ważną rolę w medycynie przy wykrywaniu nieprawidłowości chromosomalnych, takich jak aneuploidie, delecje, duplikacje i rearanżacje itp. Nieprawidłowości chromosomowe ostatecznie prowadzą do chorób genetycznych, takich jak rak, bezpłodność, zespół Downa, zespół Klinefeltera, zespół Turnera, białaczka itp. Istnieje wiele metod cytogenetyki molekularnej służących do wykrywania wyżej wymienionych wad i chorób. Wśród nich dwie potężne techniki hybrydyzacji to FISH (fluorescencyjna hybrydyzacja in situ) i CGH (porównawcza hybrydyzacja genomowa). Jednak obie metody mają zalety i wady.
