Kluczowa różnica między bakteriocyną a antybiotykiem polega na tym, że bakteriocyna jest toksyną białkową wytwarzaną przez bakterie przeciwko blisko spokrewnionemu szczepowi bakteryjnemu, podczas gdy antybiotyk jest substancją przeciwbakteryjną i wtórnym metabolitem, który zabija lub hamuje rozwój bakterii.
Substancje przeciwdrobnoustrojowe mają zdolność zabijania patogennych mikroorganizmów lub spowalniania ich wzrostu i rozmnażania. Środki przeciwdrobnoustrojowe mogą być przeciwbakteryjne, przeciwgrzybicze lub przeciwwirusowe. Substancje przeciwbakteryjne lub antybiotyki działają na bakterie, a środki przeciwgrzybicze na grzyby chorobotwórcze. Leki przeciwwirusowe zabijają wirusy. Dlatego antybiotyki są rodzajem najskuteczniejszych substancji przeciwbakteryjnych, które można stosować do zwalczania infekcji bakteryjnych. Bakteriocyna to białkowa toksyna wytwarzana przez bakterie. Działa przeciwko blisko spokrewnionym szczepom bakterii. Zatem zarówno antybiotyk, jak i bakteriocyna mają działanie przeciwbakteryjne.
