Kluczowa różnica między Prototheria Metatheria i Eutheria polega na tym, że Prototheria odnosi się do ssaków składających jaja, podczas gdy Metatheria odnosi się do torbaczy, które rodzą częściowo rozwinięte młode, a Eutheria odnosi się do ssaków łożyskowych, które rodzą dobrze rozwinięte młode.
W oparciu o główne różnice w systemach rozrodczych, ssaki można podzielić na trzy podklasy: Prototheria, Metatheria i Eutheria. Prototeria obejmuje najbardziej prymitywne ssaki, które są ssakami składającymi jaja, zwłaszcza monotremami. Metatheria obejmuje torbacze, podczas gdy Eutheria obejmuje prawdziwe ssaki łożyskowe. W rzeczywistości Eutheria jest największą podklasą ssaków.