Kluczowa różnica między biomining i bioługowaniem polega na tym, że biomining to technika wykorzystania prokariotów lub grzybów do ekstrakcji metali z minerałów, podczas gdy bioługowanie to technika wykorzystywania bakterii do ekstrakcji metali z minerałów.
Istnieje kilka różnych metod wydobywania metali z ich rud lub odpadów mineralnych. Większość z tych technik wykorzystuje do tej ekstrakcji odczynniki chemiczne. Dlatego szkodliwe produkty uboczne i szkodliwy wpływ na środowisko są częstym problemem w przypadku tej techniki. Biomining i bioługowanie to techniki stosowane do ekstrakcji metali z ich rudy za pomocą żywych organizmów.