Kluczową różnicą między NMR a krystalografią rentgenowską jest to, że NMR jest techniką analityczną stosowaną do określenia typu i liczby atomów w cząsteczce organicznej, podczas gdy krystalografia rentgenowska jest techniką analityczną stosowaną do określenia struktury atomowej i molekularnej kryształu..
Termin NMR oznacza jądrowy rezonans magnetyczny. Termin ten należy do spektroskopii podtopowej w chemii analitycznej. Z drugiej strony krystalografia rentgenowska jest rodzajem techniki krystalograficznej, w której do analizy kryształów wykorzystujemy wiązkę promieni rentgenowskich.